Причиной для ухода источники называют конфликт Ставнийчук с главой секретариата президента Верой Ульянченко по поводу подчинения главной государственно-правовой службы секретариата президента. Данная служба до сих пор была сферой компетенции Ставнийчук, тогда как Ульянченко пыталась подчинить ее себе.
Марина Ставнийчук работает в секретариате президента с июня 2007 года. Представляет интересы президента в Конституционном суде и Центральной избирательной комиссии.